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Moleküldynamik

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Re: Moleküldynamik

von Xartes » 11.03. 2010 17:48

Super, vielen Dank für deine schnell Antwort. Dann suche ich mal weiter in der Datenbank von CHARMM. Hoffe ich werde fündig.

Gruß,
Xartes

Re: Moleküldynamik

von alpha » 11.03. 2010 08:41

Wasser ist, in CHARMM zumindest, normalerweise TIP3P und hat damit eine fixe Geometrie. Was AMBER anbelangt, kenne ich mich nicht aus. Wassermodelle gibt es aber natuerlich auch variable, aber halt verschiedene...

CO2... - Ist nicht ganz so beliebt wie CO, wofuer es einige Parameter gibt.

Nebenbei: fuer das Kraftfeld von CHARMM brauchst du keine Lizenz, nur fuer das Programm...


Gruesse
alpha

Moleküldynamik

von Xartes » 10.03. 2010 12:27

Hallo liebe Chemiker,

ich bin Mathematiker und suche derzeit verzweifelt Werte für die Kraftfelder von [math]CO_2[/math] und [math]H_2O[/math]. Ich vermute, dass diese irgendwo in Amber oder Charmm zu finden sind, habe leider jedoch keine Ahnung von diesen Programmen, geschweige denn eine Lizenz für Charmm.
Nun habe ich die Hoffnung, dass einer von Euch mir weiterhelfen kann. Wichtig für mich sind die Konstanten der Terme der Bindungslänge und des Bindungswinkels.

Vielen Dank schonmal,
Xartes

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