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Datenformate für Chemie?

Sonstige Fragen zum Thema Chemie

Moderator: Chemiestudent.de Team

pheidrias
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Datenformate für Chemie?

Beitrag von pheidrias »

Hallo Chemiker!

Ich wollte mal fragen, was man am besten für Datenformate für z.B. chemische Formeln nimmt?

Ziel ist Eingabe in Datenbank (mySQL/Access).

Zu CML habe ich irgendwie nirgendwo 'ne brauchbare Doku gefunden :-(.
Deren Homepage ist ja auch seit Jahren nicht aktualisiert worden...

Wie macht Ihr das?


Danke für Antworten,
pheidrias
AV
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Beitrag von AV »

Was willst Du denn hinterher mit den Formeln anfangen, bzw. wie weiterverarbeiten?
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ondrej
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Beitrag von ondrej »

wir nehmen Java zur Darstellung und das SMILES Format zur Speicherung
pheidrias
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Beitrag von pheidrias »

Hallo!

Als erstes wollte ich einfach nur eine Chemikalien-Datenbank (was, wieviel, wo) machen.

Der Einfachheit halber direkt in Access.

Später würde ich aber gerne meine eigenen Verbindungen mit den Spektren verknüpfen etc....
zonko

Beitrag von zonko »

Eine gute Übersicht über das Thema findet sich in "Chemoinformatics" von Johnny Gasteiger. Ob das allerdings das ist, was Du für Deine "Chemikalien-Datenbank" brauchst, steht auf einem anderen Blatt (m.E. würden dafür doch Summenformeln und Namen reichen, oder?)

Gruß zonko
AV
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Beitrag von AV »

Also die Entwickler von unserer Molekülzeichenlösung habe da ja noch ein paar Sachen mehr entwickelt, unter anderem auch ein eigenes Datenbanktool ...
http://www.chemaxon.com/products.html

Vielleicht kann man das ja auch direkt einigermassen gescheit verwenden?!
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